Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtp3Q5QGU6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtp3Q5QGU6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtp3Q5QGU6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.5 ms