Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rapgef6Q5NCJ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Rapgef6Q5NCJ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rapgef6Q5NCJ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rapgef6Q5NCJ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms