Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Trim41Q5NCC3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Trim41Q5NCC3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Trim41Q5NCC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms