Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm12185Q5NCB2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm12185Q5NCB2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm12185Q5NCB2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm12185Q5NCB2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms