Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
1810065E05RikQ5NC41 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
1810065E05RikQ5NC41 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
1810065E05RikQ5NC41 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms