Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NHLRC3Q5JS37 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NHLRC3Q5JS37 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLRC3Q5JS37 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms