Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Eri2Q5BKS4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eri2Q5BKS4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eri2Q5BKS4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms