Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Spag9Q58A65 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Spag9Q58A65 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Spag9Q58A65 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Spag9Q58A65 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Spag9Q58A65 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms