Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srrm1Q52KI8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Srrm1Q52KI8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srrm1Q52KI8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms