Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf38aQ4FK66 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prpf38aQ4FK66 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf38aQ4FK66 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms