Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Carmil2Q3V3V9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Carmil2Q3V3V9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil2Q3V3V9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms