Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnpc3Q3UZ01 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rnpc3Q3UZ01 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnpc3Q3UZ01 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.6 ms