Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Kdm5aQ3UXZ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Kdm5aQ3UXZ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
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