Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
D130052B06RikQ3UW13 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms