Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnga4Q3UW12 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnga4Q3UW12 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnga4Q3UW12 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga4Q3UW12 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnga4Q3UW12 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms