Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnrc6cQ3UHC0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnrc6cQ3UHC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnrc6cQ3UHC0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms