Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy4Q3TYX8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy4Q3TYX8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rufy4Q3TYX8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy4Q3TYX8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms