Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hhla1Q3TYV2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hhla1Q3TYV2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hhla1Q3TYV2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms