Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh5Q3TSG4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh5Q3TSG4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh5Q3TSG4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alkbh5Q3TSG4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alkbh5Q3TSG4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alkbh5Q3TSG4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alkbh5Q3TSG4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh5Q3TSG4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alkbh5Q3TSG4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Alkbh5Q3TSG4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms