Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQR0

Pgap2, Post-GPI attachment to proteins factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap2Q3TQR0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pgap2Q3TQR0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pgap2Q3TQR0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pgap2Q3TQR0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pgap2Q3TQR0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms