Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CiartQ3TQ03 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CiartQ3TQ03 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CiartQ3TQ03 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms