Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdlim7Q3TJD7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdlim7Q3TJD7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdlim7Q3TJD7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms