Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem104Q3TB48 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem104Q3TB48 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem104Q3TB48 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms