Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PGS1Q32NB8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGS1Q32NB8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGS1Q32NB8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGS1Q32NB8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGS1Q32NB8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGS1Q32NB8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGS1Q32NB8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGS1Q32NB8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGS1Q32NB8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms