Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KncnQ307W7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KncnQ307W7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KncnQ307W7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1893.9 ms