Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHK6

Gsdmc2, Gasdermin-C2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc2Q2KHK6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gsdmc2Q2KHK6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsdmc2Q2KHK6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gsdmc2Q2KHK6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gsdmc2Q2KHK6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms