Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A12Q1EHB4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A12Q1EHB4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A12Q1EHB4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms