Protein–RNA interactions for Protein: Q16739

UGCG, Ceramide glucosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UGCGQ16739 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UGCGQ16739 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UGCGQ16739 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UGCGQ16739 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UGCGQ16739 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UGCGQ16739 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms