Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NTRK2Q16620 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTRK2Q16620 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK2Q16620 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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