Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RPS6KB2-205ENST00000525088 5528 ntTSL 214.31□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 ZBTB44-203ENST00000445008 3848 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 SH2B1-211ENST00000566209 533 ntTSL 414.13□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FBXO42-203ENST00000456164 1153 ntTSL 214.08□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FKBP1A-209ENST00000612074 409 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.348e-11■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.358e-11■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-218ENST00000471892 687 ntTSL 312.52□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MYRF-207ENST00000539361 3324 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RFXANK-206ENST00000535017 546 ntTSL 312.06□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 APBB3-209ENST00000504872 538 ntTSL 411.86□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 PPRC1-205ENST00000489648 744 ntTSL 511.22□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FKBP1A-202ENST00000381719 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 WHRN-204ENST00000374059 3278 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-213ENST00000453824 561 ntTSL 510.69□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-206ENST00000518283 574 ntTSL 49.53□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 HUWE1-213ENST00000489876 754 ntTSL 48.9□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.13e-11■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.194e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-214ENST00000454473 3005 ntTSL 57.34□□□□□ -1.234e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-224ENST00000512140 2876 ntTSL 27.1□□□□□ -1.274e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.274e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-203ENST00000517672 548 ntTSL 56.85□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-228ENST00000523993 581 ntTSL 36.71□□□□□ -1.344e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-211ENST00000441656 2899 ntTSL 56.51□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-213ENST00000519142 696 ntTSL 56.33□□□□□ -1.44e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-205ENST00000418329 2912 ntTSL 56.17□□□□□ -1.424e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 BRD8-208ENST00000428808 754 ntTSL 45.69□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-222ENST00000522702 544 ntTSL 45.12□□□□□ -1.594e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.664e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 23.74□□□□□ -1.814e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-9■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.742e-9■■■■■ 36.2
PCBP1Q15365 MYO9B-209ENST00000597073 2087 ntTSL 519.47■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 MYO9B-208ENST00000596942 584 ntTSL 519.15■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 MYO9B-210ENST00000597572 660 ntTSL 518.77■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 MYO9B-213ENST00000598419 544 ntTSL 518.5■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 MYO9B-207ENST00000595641 6215 ntTSL 513.2□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 418.06■□□□□ 0.486e-27■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 SEC24D-208ENST00000506622 1319 ntTSL 216.23■□□□□ 0.193e-13■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.163e-13■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 SEC24D-201ENST00000280551 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.653e-13■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 SEC24D-209ENST00000509818 1870 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.863e-13■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 SEC24D-205ENST00000503683 602 ntTSL 46.27□□□□□ -1.413e-13■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 SEC24D-214ENST00000514561 3806 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.653e-13■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.956e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.646e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 TIMM17B-206ENST00000472645 804 ntTSL 317.71■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 TIMM17B-205ENST00000466995 1528 ntTSL 216.75■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 36.1
PCBP1Q15365 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 35.9
PCBP1Q15365 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.546e-8■■■■■ 35.9
PCBP1Q15365 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 35.9
PCBP1Q15365 ADK-204ENST00000478611 443 ntTSL 313.93□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 35.9
PCBP1Q15365 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.086e-8■■■■■ 35.9
PCBP1Q15365 TBC1D10B-203ENST00000475650 2484 ntTSL 216.44■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-9■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 TBC1D10B-205ENST00000478158 4614 ntTSL 213.12□□□□□ -0.313e-9■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.124e-9■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.054e-9■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-10■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.134e-10■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.254e-10■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.554e-10■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.554e-8■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.794e-10■■■■■ 35.8
PCBP1Q15365 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.596e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 NR2F6-202ENST00000596878 731 ntTSL 327.82■■■□□ 2.042e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.86e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.636e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 ZNF580-206ENST00000592881 1019 ntTSL 323.63■■□□□ 1.371e-12■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 TMC6-213ENST00000589933 580 ntTSL 323.54■■□□□ 1.366e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.181e-12■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.181e-12■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 ZNF580-205ENST00000592461 377 ntTSL 322.25■■□□□ 1.151e-12■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-205ENST00000565110 575 ntTSL 521.35■■□□□ 1.016e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-208ENST00000566401 522 ntTSL 321.32■■□□□ 16e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 16e-7■■■■■ 35.7
PCBP1Q15365 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.996e-7■■■■■ 35.7
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