Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NKX1-1Q15270 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NKX1-1Q15270 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NKX1-1Q15270 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
NKX1-1Q15270 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NKX1-1Q15270 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
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