Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
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