Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
R3HDM1Q15032 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
R3HDM1Q15032 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
R3HDM1Q15032 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
R3HDM1Q15032 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
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