Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN4PQ13434 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MKRN4PQ13434 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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