Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCGQ13326 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGCGQ13326 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCGQ13326 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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