Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
HMGXB3Q12766 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
HMGXB3Q12766 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC42.51■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
HMGXB3Q12766 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
HMGXB3Q12766 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
HMGXB3Q12766 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
HMGXB3Q12766 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms