Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrioQ0KL02 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrioQ0KL02 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrioQ0KL02 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrioQ0KL02 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms