Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbp2Q08652 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbp2Q08652 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms