Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDH1Q08174 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDH1Q08174 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH1Q08174 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH1Q08174 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms