Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARAQ07869 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPARAQ07869 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARAQ07869 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARAQ07869 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms