Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MestQ07646 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MestQ07646 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MestQ07646 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MestQ07646 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MestQ07646 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MestQ07646 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MestQ07646 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MestQ07646 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MestQ07646 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MestQ07646 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MestQ07646 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MestQ07646 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MestQ07646 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MestQ07646 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MestQ07646 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MestQ07646 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MestQ07646 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MestQ07646 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MestQ07646 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MestQ07646 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MestQ07646 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MestQ07646 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MestQ07646 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MestQ07646 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MestQ07646 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MestQ07646 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MestQ07646 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MestQ07646 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MestQ07646 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MestQ07646 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MestQ07646 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MestQ07646 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MestQ07646 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MestQ07646 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MestQ07646 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MestQ07646 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MestQ07646 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MestQ07646 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MestQ07646 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MestQ07646 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MestQ07646 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MestQ07646 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MestQ07646 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MestQ07646 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MestQ07646 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MestQ07646 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MestQ07646 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MestQ07646 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MestQ07646 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MestQ07646 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MestQ07646 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MestQ07646 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MestQ07646 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MestQ07646 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MestQ07646 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MestQ07646 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MestQ07646 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MestQ07646 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MestQ07646 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MestQ07646 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MestQ07646 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MestQ07646 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MestQ07646 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MestQ07646 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MestQ07646 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MestQ07646 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MestQ07646 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MestQ07646 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MestQ07646 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MestQ07646 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MestQ07646 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MestQ07646 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MestQ07646 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MestQ07646 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MestQ07646 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MestQ07646 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MestQ07646 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MestQ07646 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MestQ07646 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MestQ07646 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MestQ07646 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MestQ07646 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MestQ07646 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MestQ07646 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MestQ07646 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MestQ07646 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MestQ07646 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MestQ07646 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MestQ07646 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MestQ07646 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms