Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrx2Q06348 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrx2Q06348 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrx2Q06348 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms