Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBPJQ06330 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RBPJQ06330 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms