Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTDSPL2Q05D32 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTDSPL2Q05D32 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms