Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Top1Q04750 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top1Q04750 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1Q04750 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Top1Q04750 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1Q04750 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Top1Q04750 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1Q04750 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top1Q04750 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top1Q04750 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms