Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Epha4Q03137 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epha4Q03137 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms