Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nucb1Q02819 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nucb1Q02819 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nucb1Q02819 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nucb1Q02819 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nucb1Q02819 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms