Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCEQ02156 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCEQ02156 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCEQ02156 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms