Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snai1Q02085 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snai1Q02085 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Snai1Q02085 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snai1Q02085 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms