Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ROR1Q01973 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ROR1Q01973 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROR1Q01973 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms